1945年，游学归来的刑侦专家程慈航在码头突遇险情，亲历多方势力为争夺一只铁箱而大开杀戒。这只看似普通的铁箱内，竟存放着日军细菌武器的绝密档案。警察厅厅长莫采石将铁箱妥善存入档案馆密室，然而内贼难防，警员刘阿常暗中倒戈，致使绝密档案在深夜不翼而飞，案情瞬间陷入扑朔迷离的迷局之中。获悉此案关乎日军细菌武器，程慈航毅然向“叔叔”莫采石请战。总署刑侦警察局局长霍然随即特聘其为“布衣侦探”。走马上任后，程慈航凭借敏锐的洞察力迅速寻得蛛丝马迹，顺藤摸瓜接连捕获重大线索。然而，他的查案之路却处处受阻，总有人在暗处抢先一步对相关人员进行杀人灭口。抽丝剥茧之间，程慈航面临着多重严峻考验：既要应对刑侦处处长严达庆关键时刻的百般阻挠，又要揣测莫采石讳深莫测的真实态度，还要与觊觎档案已久的老同学哈金斯及日本间谍展开惊险博弈。随着内贼刘阿常的命丧黄泉，一抹关键线索浮出水面，案情的矛头竟直指莫采石——种种迹象表明，他才是幕后觊觎并企图独吞绝密档案的真正黑手。幕后黑手究竟是谁？丢失的档案又究竟藏于何处？程慈航究竟如何破解这重重迷局，一切答案尽在年代悬疑传奇《昙花梦》中。