故事发生在烽火连天的抗日战争时期。随着军统谍报网络接连遭到日特的致命破坏，局势岌岌可危。军统当家人戴笠（王岗 饰）力排众议，从集中营中保释出因故入狱的少校陈一鸣（庹宗华 饰），授命他组建代号为“眼镜蛇”的精锐特工小组，潜入敌占区执行一项绝密暗杀任务——锄杀日特驻华头目中村一郎（于震 饰）。领命后的陈一鸣火速行动，四处招募各路身怀绝技的顶尖高手，并展开严酷的战前培训。 此时，多方势力暗流涌动。美军上校梅乐斯紧急求见戴笠，要求其设法营救被中村一郎逮捕的美军特工史密斯夫妇；与此同时，中共高级特工黄天明（侯勇 饰）截获了由南京地下党成员黄云睛（吴晓敏 饰）冒死送出的绝密情报。出于抗日民族统一战线的全局考量，黄天明奉上级指示，巧妙地将史密斯夫妇的关押位置透露给了军统南京站高站长，暗中促成国共两方在抗日任务上的默契配合。 一场惊心动魄的谍战暗战就此打响。陈一鸣率领“眼镜蛇”特工小组乔装潜入日军严密防守的医院，在惊险万分中率先救出史密斯夫妇。随后，他们顶住巨大压力，开始执行此次行动的终极任务：刺杀中村一郎。置身于敌人的心脏地带，四面楚歌的特工小组与狡猾残忍的中村一郎展开了步步惊心的生死博弈。他们究竟能否在日特的层层铁壁中成功突围，顺利完成任务？