满清入主中原，百废待兴之际，清世祖顺治帝不幸驾崩。临终前，他将皇位传予三阿哥玄烨（即康熙，张智霖饰），并授命索尼、苏克萨哈、遏必隆及鳌拜（林嘉华饰）四位重臣辅政。玄烨童年并未深得父皇欢心，后更因染上天花被迫迁居宫外。孤苦无依之际，他结识了鳌拜，被其英雄气概所吸引并随之习武，两人由此结下了一段亲如父子的深厚情谊。玄烨即位，改元康熙。初登大宝的康熙视鳌拜为榜样，无论武功政事均十分信任；而鳌拜亦借机利用这层关系在朝中排除异己。随着康熙日渐长大，接连发生的“明史案”、“汤若望案”及“圈地换地事件”，让他逐渐看清了鳌拜嚣张狂妄的真面目，更坚定了借大婚之机早日亲政的决心。康熙自幼与冰月公主（梁小冰饰）青梅竹马，遂向太皇太后提议立其为后。不料太后以冰月并非安亲王亲生女儿、出身不明为由断然拒绝。适逢靖南王之弟耿聚忠上书求亲，太后乘机将冰月下嫁予耿聚忠，以此达到拆散两人并拉拢靖南王的双重政治目的。眼见心爱之人被迫出嫁，康熙无限心伤，但以国事为重，只得依太后之命在芸芸佳丽中选中索尼之孙女芳仪为后，将全副精力转投于国家政事。此时鳌拜势力日益坐大，多次与皇权公然作对。康熙虽贵为天子却暂难抗衡，加之难舍冰月下嫁他人而终日忧愁，幸得太后多番严厉训导才如梦初醒，暗下决心誓要从鳌拜手中夺回政权。鳌拜察觉康熙似有夺权之势，竟以回乡祭祖为由请辞，有意让康熙尝尽事事受阻、路路不通的苦果。康熙迫于无奈，只得将鳌拜迎回京师重掌朝政。在此内忧困局下，康熙微服离京寻访有识之士，偶遇前朝朱三太子（朱慈安），两人结为师生。朱三太子不避国仇家恨，为康熙提供治国良策。期间，康熙惊见朱之养女水月（梁小冰分饰）貌似冰月，移情之下渐萌爱意，待厘清对水月的真爱后，却惊觉行踪已被鳌拜知悉并派人追杀。康熙一方面为对付鳌拜而殚精竭虑，另一方面又惊闻三藩蠢蠢欲动。幸得冰月暗中协助，拉拢三藩以对抗鳌拜之兵力，并启用索额图加强宫中守卫。康熙究竟有何妙计对付心思缜密、不可一世的鳌拜？这其中又将发生怎样的变化与转机？万人之上的帝王，是否真能与心中所爱长相厮守？